分子结构是通过什么方式来知道的呢？

原先是根据规律和组分猜测，到了20世纪多用谱的方法。
质谱：确定分子量，局部分子结构的质量
红外光谱：确定化学键的类型，识别特定基团
紫外光谱：确定特定的结构
核磁共振氢谱：识别该分子中氢原子（氕）的位置（非常重要），类似的技术也可以检测其它原子，如C-13，的位置
X射线衍射：测定晶体的结构
在这几种手段的帮助下，结合量子化学理论，和若干年来积累的一系列理论和经验，科学家们像侦探一样猜测，排除别的可能，最终搞定一种结构。
此外，特定的局部结构有特定的性质，在知道分子组分的情况下可以通过反应来猜测。对于大分子，可以通过化学反应拆成小分子再各个击破。此外，在自然界发现的复杂分子，往往人们会在实验室里合成出可能的结构，再检测哪种结构的特性和原分子一样，就是这种结构。
最毒的方法是放隧道扫描镜底下直接看，不过没听说有人这么干过。

核磁共振，红外

RMN X射线 红外线 质量测量
总之有非常的多的方法，通过光谱之类的图表来确定