离子对色谱的保留机理是什么?这种类型的色谱在分析应用中，最适宜分离的物质是什么?

这个在教科书上说的比较详细。
简单地说一下：
有机酸或生物碱，有一定的解离，但离解较弱，不适合用离子交换色谱。但直接采用正相色谱保留值太强，用反相色谱保留太弱，用离子对色谱则比较合适。
它的原理是：在流动相中加入与目标物质离子电荷相反的离子，与其形成疏水性离子对化合物，从而能在固定相和流动相之间进行分配。
在色谱中的应用主要是生物碱的分析，因为普通的色谱柱pH范围是从中性到偏酸，有机酸可以通过调低流动相的pH（<pKa）来使其处于非解离状态而达到分离，而生物碱需要调高pH（>pKb）才能处于非解离状态，这样的话硅胶基质色谱柱受不了。
不过，现在也有高pH范围的色谱柱，也可以不采用离子对色谱，毕竟流动相中加入SDS之类的东西，不容易平衡，对色谱柱也有损害。
希望能对你有所帮助。