我父亲07年有劳动争议,起诉到仲裁直到09年6月才给裁决,仲裁是否违法

仲裁违法。理由同样是《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十三条 仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自劳动争议仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。案情复杂需要延期的，经劳动争议仲裁委员会主任批准，可以延期并书面通知当事人，但是延长期限不得超过十五日。逾期未作出仲裁裁决的，当事人可以就该劳动争议事项向人民法院提起诉讼。
你父亲可以就超过法定仲裁时间才下达裁决书向上级举报，投诉，可以提起行政诉讼。

任何机构既然履行职责，必然有相应的义务约束。逾期没有裁决向法院起诉的立法本意是给劳动者提供一个救济的途径，而不是仲裁庭逃避义务的借口。否则仲裁庭都不出裁决算了。

不违法，根据中华人民共和国劳动争议调解仲裁法第四十三条之相关规定，仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自劳动争议仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。案情复杂需要延期的，经劳动争议仲裁委员会主任批准，可以延期并书面通知当事人，但是延长期限不得超过十五日。逾期未作出仲裁裁决的，当事人可以就该劳动争议事项向人民法院提起诉讼。当案件受理时间超过60天你父亲可就所申请的请求向单位所在地的法院提起诉讼，可你父亲没有提起诉讼，所以仲裁部门那么晚做出裁决是不违法的，不过貌似时间有点长啊。
题外话，XIANHUREN的回答貌似有点外行啊。