我是安徽09届文科考生，考了501分，刚达二本线.填安徽财经大学商务院的会计专业(三本)可以吗

可以。
不过，建议你填个二本，并且要服从调剂，三本的学费太高。
这里建议你，还是和你班主任或者是学校里比较了解你、又和你关系不错的任课老师好好的商量一下，让他们以他们的经验给你一定的建议，是非常好的。同时和家人商量商量，以你的兴趣填写志愿。现在社会上会计人员太多，资质比较好、资历比较深的人不多。你自己要把握好。
我刚大学毕业不久，就这两点建议，仅供参考。