专科生报考研究生要两年以后，是不是这期间还要参加自考考试取得本科课程合格才行？

不是的。专科生参加研究生考试，叫同等学历，要有两年工作经验，还要加考两专业课，说是两年工作经验，其实没人查你档案，就是毕业两年就是了。
如果你取得了自考本科学历，就不用加试两科。
我建议你取得本科学历好，考研的时间安排是很紧张的，再加两科负担是很。而且你学了本科，更了解专业知识，也更有竞争力。

不需要