这种情况能不能申请检验方法专利？

可以的.
方法本身的独创性还是要考虑的,如果拿一个已经知道的方法,挪用到药品的内毒素的检测上,创造性是有问题的.

当然是可以的，只要这个方案具备新颖性、创造性和实用性。到时候提交的申请资料也没有问题的话。审查通过后国家知识产权局就会授予申请人专利权。