高氯酸钠对dna提取的影响

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/05/14 02:05:02
高氯酸钠对于放线菌的dna提取有没有影响啊?我们已经提了几天都没有出现dna沉淀,不明白他有没有破坏作用。。。 方法如下:1.5~2g湿菌体,加入20ml 1×TES,充分打散菌体
↓加入2mg溶菌酶
37℃水浴保温30-60分钟,温和摇动
↓加入2ml 20% SDS (终浓度为2%)
55℃水浴保温10分钟,然后冷却至室温
↓加入100μl蛋白酶K溶液
55℃水浴保温30-60分钟,温和摇动
↓加入5ml 5M NaClO4溶液
加入等体积(27ml) P:C:I混合液,充分振荡使其呈乳浊液,约30~60分钟
↓5000rpm,4℃,20-30分钟离心
用剪去枪尖的枪头吸取上层水相,转移至新的离心管中,重复用P:C:I抽提2-3次至没有蛋白膜出现为止
↓加入70μl RNase溶液
37℃水浴保温30-60分钟

加入等体积的C:I混合液,充分振荡
↓5000rpm,4℃,20-30分钟离心
转移上层水相至烧杯中,冰浴,加入1/10体积预冷的3M NaAc-1mM EDTA-Na2及等体积的冷异丙醇,使DNA沉淀
↓用玻璃棒绕起DNA丝
望各位高手指点一二!!不胜感激。。
不是我们是进行了两次抽提,而且是将上清液提取出来后再加的酶处理,不要理解错了,能不能给一下进一步的解释呢?
大学生,试验方法是一个师姐的论文,我们用这种方法帮他完善,别的方法我也查过,现在我怀疑是加入异丙醇后冷藏的时间不够,我们就等了十几分钟,上清很透明就放弃了,这样吧,我再去试试,对了回来给你追加分!!不过先谢过了。。

5ml 5M NaClO4溶液 是为了调节盐浓度DNA溶于高盐

55℃水浴保温10分钟,然后冷却至室温
↓加入100μl蛋白酶K溶液
55℃水浴保温30-60分钟,温和摇动

水浴60℃保持最少1 h,不时摇动

你这步骤相信也是从书上抄来的 看看有没有抄错 如果是正规的教科书应该都是别人试过的 不会有问题的 不过相信这方法比较古老了 提取的效率不会太高的

你是高中生还是大学生?如果有条件的话可以用用以下方法 我们一般是这样提的每每成功的 不过最后看到的不是DNA丝 是沉淀

用用SDS法
1. 研磨,加入0.4ml提取buffer,充分混匀。

提取buffer:0.4 M NaCl2, 10 mMTris-Cl(pH8.0), 2 mM EDTA。

2. 加入0.04ml 20%的SDS(终浓度2%)、0.008ml 20mg/ml的蛋白酶K(终浓度400g/ml),充分混匀。
3. 水浴60℃保持最少1 h,不时摇动, OR overnight 。
4. 随即加入0.3ml 6M的NaCl2,剧烈涡旋震荡30s。
5. 转速12000rpm离心10min。
6. 将上清转移入新的离心管中,加入等体积的异丙醇,混匀;放置-20℃保持1 h
7. 转速12000rpm离心10min,弃去上清,DNA沉淀用70%的乙醇洗1-2次。
8. 常温干燥、将残留乙醇挥发完,加入0.3ml ddH2O溶解DNA;可以立即用于PCR分析或放置-20℃保存。

PCL抽两次最多了,苯酚对DNA的伤害很大,有时候我抽植物都不用苯酚。抽完了用CL再抽一次,为的是除去苯酚,像你们那样苯酚还在溶液里就37℃保温,DNA不断光才见鬼呢。