所得税季度报表中的营业成本包括不包括期间费用，那么营业收入减营业成本得出利润总额不是没有逻辑性？

你说的是所得税季度申报表，
季度申报仅仅是预缴，
从国家的角度，
要尽量保证税收的完整性及收税的及时性，
所以没有扣除期间费用，增减投资收益、营业外收支等。

在汇算清缴时，
会根据你本年度的实际情况进行缴算，
多退少补。

不包含,本来就无直接关系(还有营业外收支等)

这张表中的逻辑关系本来就不是1行-2行＝3行的。