蛋白质二级结构究竟是链内还是链间

首先，蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链中某一肽段的局部空间结构，并不涉及氨基酸残基侧链的构象。二硫键是两个半胱氨酸残基侧链的巯基脱氢而成的，所以它不属于二级结构及更高级的空间结构。维系二级结构的化学键主要是肽链上酰胺氢原子和羰基氧原子之间形成的氢键。

其次，β-折叠是通过肽链间或肽段间的氢键来形成的。也就是说，它既可在不同肽链之间形成，也可在同一肽链的不同肽段之间形成。可以想象，由一条肽链折返形成的β-折叠多为反平行式。

还有，胰岛素是由两条肽链通过两个二硫键连接而成的。
最后，希望这些对您有帮助。

这个我也不很确定，发表一下个人看法

我认为应该以链内作用为主，如α-螺旋是链本身螺旋上升，β-转角是1号氨基酸和4号氨基酸之间的氢键作用
另外β-折叠就不太好讲，主要是各链的充分伸展，或许也可以是不同链的
但应该以链内为主
链间作用可能就是超二级结构和三级结构了吧，发展到亚基就有四级了。。

链内作用

链内链外跟是不是二级结构没关系，你可以是链内形成二级结构，比如α-helix，也可以链外形成二级结构，比如有些β-sheet。一般就这么认为。

不过貌似蛋白结构的描述中，二级结构定义是根据主链内的氢键来定义的，主链和旁链、旁链之间的氢键都不算，二硫键这种不是氢键的化学键更不计算在内了。所以从狭义的描述角度出发，二级结构只针对主链而已。