我是施工单位的，由于桩的影响，打桩队需要补桩，打桩队不是很我们，停工报告应该是谁写，

如果打桩队和你们是属于总包与分包，那么停工报告由你们负责。
并且产生的后果，比如工程延期等，也应由你们承担。
但你们可以向打桩队索赔。
如果打桩队是甲方指定的（经常出现这种情况，场地平整和桩基公司由甲方指定），那么可以找甲方协调。

是你的分包，就你写。