房东发票的税收由我们付,请问这合理吗?我们是否可以因无发票而拒交房租?

个人出租商铺等非住宅行为应申报缴纳的具体税种包括：营业税、城建税、教育费附加、土地使用税、房产税（城市房地产税）、个人所得税和印花税等。
楼主这种情况，可以凭租赁合同向地税举报，一旦查实，房东将受偷税处罚。当然，你也可以先跟房东讲明，再次协商，如果实在不行就看着办吧。
房屋租赁收入的纳税义务在出租方，而不是承租方，这与租赁合同关系不大。

不能，因为当初也没有说是由房东付。如果因为要出发票而要增加他的费用，那么这个费用肯定要由承租方来承担，因为他要收的房租是实收，而不是扣除税后的金额。法律上是说由房东承担，但羊毛出在羊身上。