自由落体的物体为参考系的话,竖直上抛的物体做的是匀速直线运动

首先，若以自由落体的物体为参考系的话，相当于对每个物体增加一个反向（向上）的加速度g，与原有的重力加速度抵消，竖直上抛的物体做的就是匀速直线运动。
对于你的具体问题，以自由落体的物体为参考系，两小球都作匀速运动，第二个小球相对第一个小球也做匀速运动，因此只需用其相对距离除以相对速度即可得出相遇的时间。

两个加速度相同的物体可互相做参考系

不变

要仔细理解相对运动的概念，有相对速度，也有相对加速度，当他们的加速度都相同时，相对加速度也就是0，自由落体和竖直上抛的加速度都是g，以自由落体为参照物，竖直上抛的加速度就是：a相对=a上-a落=g-g=0，既然加速度是0，当然就是匀速直线运动了啊