为什么检测一些基因往往要用RT-PCR？直接扩增其DNA不行吗？

那是为了检测这个基因是否表达，而不是检测是否存在。只有表达的基因才会转录成RNA。

如果是为了检测基因是否表达，这要用RT-PCR，扩增DNA不能证明特定组织或是特定条件下的基因表达。
更多情况下的RT-PCR是为了采用同源克隆的方法获得新基因。