个税系统中增加人员身份证与名字不符会有什么后果

这个没关系，个税系统中是以身份证号码来定的，你放心，就算是名字不符，只要身份证号对应的是那个人就没事。

做申报时，税务的系统是查不出姓名与身份证号码不符的。
但做申报时出现错误的员工如果需要打印完税证明，税务会按错误的信息打印，那个时候，这个错误就会表现出来。