尚未离婚，男方将子女藏起来，女方该怎么办？

说实话,很难.

虽然很值得同情与支持, 这也是法庭驳回男方诉讼的原因,法律要保障你的合理利益. 但是 不管离与不离, 你都得 为孩子 的健康成长 多考虑考虑.
如果你的病没有传染性, 那相信你老公是会 改善 他的行为的.否则的话,你也 用不着 强求之. 因为 强行起诉的话,我觉得是 弊 大于 利, 没那个 必要.
建议你跟老公之间多交流协商,也可以请专业医生帮忙说解.

用法律的武器 来保障自己的合法权利！

可以再次向法院提起诉讼

如果你已经确信这个真的没法协商了，就只有通过法律途径了，不过法律上你是可以提起诉讼的，一般不回同意离婚，除非女方提出，但是法院为了孩子很有可能将孩子判给他，同时会给女方以物质等方面的偏向，请慎重考虑