如果我所在的公司遭盗窃，所有损失会是我们员工全部赔偿吗？

不应当由员工承担责任，除非有证据证明是员工的过失或者是监守自盗。

是否承担赔偿责任，要根据员工有没有过错来确定，如果员工玩忽职守，比如晚上关门没有将所有门锁好或者窗户未关等，为盗窃提供了条件，那么员工要根据过错程度承担一定的赔偿责任。如果完全按照公司要求关好门窗，那么不承担任何赔偿责任。
一个企业生产经营就应当自己承担包括失窃在内的全部风险，公司让你们赔偿全部损失是将盗窃风险全部转嫁给员工，这是错误的，你可以劳动局申请仲裁解决。