仓库的数量与实际上的不符要是被税务局查到会被怎么处理？

按照您的表述，有多计成本或者少计收入的嫌疑，存在税务法律风险。
根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条规定：纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或者在账簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。
对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
因此，建议您做好账务处理，进行自查申报补缴税款，规避税收法律风险。

帐实不符，可能是你们销售了没开票给客户，属于严重的偷税行为，查到以后要补交增殖税和所得税等

进行自查补报！

会有偷税的可能。