在国外（韩国）买鞋子，鞋盒是不让带过海关么？

不是不让带盒子，只不过你携带盒子有可能让海关的人认为这不是自用物品，而要求你重新保税，惹来更多的麻烦事情。
所以通常去旅游的时候买的东西都不建议携带包装入境

不会吧，没听说过，是不是你鞋盒太大，超了他们可携带到机舱的体积？

打到行李里，应该没事