A公司欲在我老家设一小分公司，我入40%股份，不知如何签署协议，希望具体说下，谢谢!

入股40%，那你应该是股东，应该有股权证书，股东股权证书会有体现你占股40%。

如果你拿不到股权证书，要用协议去约束，我觉得还是不大可靠，虽然理论上来讲协议书是有法律效应的。

如果本地市场由于全权运作，那你就相当于是你自己公司的职业经理人，那你要签署的就是约定双方责任与义务的普通聘书罢了。