我是自考本科学的是机电一体化工程，能报民航的自动化学院的研究生吗？他说不许跨学科是不是文理科啊

不许跨学科,指的是专业，不是文理科。例如：你学的是建筑，你就不能报自动化。
现在你学的是机电一体化，与自动化是相近专业，可以报自动化，电气工程等等，不算跨学科

跨专业是指具体专业的跨，不是文理的跨

不是的，可能是要对口的把

都可以。我就是从化学跨到金融的。