我家住水库边上，是当年国家统一移民，近几年水位居高不下，因浸泡等原因使房屋受损，水利局是否应该赔偿

这问题相当麻烦，多半自担损失了。

你可以查一下水库水位是否有水位限制的资料，如果超限，可以叫水库赔偿；
既然是国家统一建房，现在不好住了，可以要求政府补助。

此两个都是不好对付的主，难啊。

这个要去找当地的移民局，移民不是水利局负责的事情