CIA和FBI是怎样分工合作的

中央情报局CIA是世界上最具影响力的情报机构、特工机构、间谍反间谍机构。是针对一些国家和国际性组织的。更多的是提供情报、侦查工作，服务对象其实更偏向于政府部门。
而联邦调查局FBI则是针对违反美国联邦法律的犯人的。它的性质其实是一种警察机构，服务对象是司法部门。

所以，如果你关注时事，多看报纸，就不难发现两者不像电影当中那样，它们之间的合作其实并不算多。
首先，CIA的行动对象并不一定是犯法者或非法组织，但FBI却一定是针对违反美国联邦法的犯罪行为的。
其次，CIA的行动范围有很大一部分是在国外执行（当然也有针对国内的），而FBI则是针对国内的（除非国内的联邦法犯人外逃到国外了。那也必须看逃到的国家是否有引渡条约，就算有，因为这会关乎国家主权问题，所以必须与对方国进行复杂的谈判以争取FBI海外调查特权以及必要时武力行动特权。不过这样会耗费太多的精力，所以FBI的海外行动记录几乎没有。）。
再者，单靠CIA也没有在海外逮捕犯人的权利。（举例，1960年以色列特工在布宜诺斯艾利斯，未经阿根廷政府同意擅自抓捕纳粹战犯阿道夫・艾希曼，曾引起了阿根廷与以色列的国家关系恶化。）

当然，两者也并不是说就完全没有合作的可能。如果楼主执意要知道CIA和FBI合作的方式，本人不敢不懂装懂，一下只是推理，仅供参考。
一、大前提，是美国国内的，反联邦法的组织性的重大犯罪，大到不得不请CIA这样的庞大机构出手相助。（如美国国内的反人类组织，邪教组织，黑帮，恐怖分子等。不过恐怖分子的话，恐怕需要军队出面，FBI要闪一边去了。）
二、一方给情报，一方出人力。再次强调，CIA是情报机构，所以更多的应该是提供间谍情报。而FBI则负责大规模行动打击。（当然，论素质、能力、威望，CIA的特工们都远胜于FBI的探长们。只是CIA从不进行大规模的行动，因为它不是暴力机关。）
三、有相关的立法程序。刚才也提到了，CIA服务于政府部门，而FBI服务于司法部门。要动用两者，必需协调联邦法院和白宫，而要做到这一点，恐怕只有通过相关的立法才行。

CIA对外FBI对内

本来就是没有什么关系的两个部门。FBi是美国联邦的执法机构，CIA是美国的情报机构。