高中党校结业，现大三，毕业后在私企入党有用吗？

这个应该是没用了，你的关系都已经断结了，党章里说了2年内没有参加党的任何会议，或不交党费算自动退党（具体的记不太清楚了），按这个算你现在已经不是党员了，这个证件也是无效的了。

在一个高中的入党在大学有的也是不认可的。

应该有用。也就是省了一个步骤而已。

党校结业证书不是入党的必要材料。没有也可以正常入党。但还是留着吧，在缩短入党时间上应该还是有一定作用的。
另外，要入党的话，要经过至少一年以上的积极分子阶段，还是抓紧时间递交申请书吧。