请问用在51单片机上的程序直接编程到AVR的单片机里可以吗？

不可以,连长的最像51的mega16都不可以，首先avr不可以直接位寻址。如p1.1=0;可以这么写，但不可以写pa.1=0;虽然都可以用C语言编写。
AVR端口是真正的双向端口，不像51伪双向。这也是AVR的一项优势，只是操作时大家注意DDRn就可以了。真正双向端口在模拟时序方面不如伪双向的方便。
DDRn PORTn PINn 解释：n为端口号：ABCDE
DDRn：控制端口是输入还是输出，0为输入，1为输出。个人记忆方法：一比零大所以往外挤，即1为输出，0为输入。
PORTn：从引脚输出信号，当DDRn为1时，可以通过PORTn＝x等端口操作语句给引脚输出赋值。
PINn：从引脚读输入信号，无论DDRn为何值，都可以通过x＝PINn获得端口n的外部电平。
当引脚配置为输入时，若PORTxn 为"1“，上拉电阻将使能。内部上拉电阻的使用在键盘扫描的时候还要说到。
端口更详细功能及介绍以及端口第二功能请参考数据手册。
端口引脚配置
DDxn PORTxn PUD (in SFIOR) I/O 上拉电阻说明
0 0 X 输入 No 高阻态 (Hi-Z)
0 1 0 输入 Yes被外部电路拉低时将输出电流
0 1 1 输入 No高阻态(Hi-Z)
1 0 X 输出 No输出低电平 ( 漏电流)
1 1 X 输出 No输出高电平 ( 源电流)

不可以，他们的内核不一样，不过整体的程序框架不用改，细节修改就可以了

因为指令不一样，所以需要改相应的命令重新编译就可以了。

使用C语言的源码，在51的编译器和AVR的编译器上分别编译。

不可以，对应端口操作。AVR对应端口需要初始化.还有对应寄存器的初始化及操作都不一样，但是主要功能你有了，对应改改就可以通过ICC AVR编译一下后下载到AVR中去的。