我司的生产机器进行了大修，费用大概1、2万，我应该让对方开配件的专用发票还是开大修费的专用发票？

前提你的费用1.2万，和机器的原值相比如果太小。开大修费，就做制造费用-维修费，开配件，就做领用后，进制造费用-维修或是机物料消耗。
开成配件还可能抵扣，开配件好一些。
问题2 做原材料-五金配件，领用时进制造费用-维修或是机物料消耗。