我公司注册资本10万元，而实际投入50万元，如何记账

你们是可以增资的。

注册资本经缴纳万分之五的印花税的。

多出来的40W挂其他应付款就是了。

按实收资本入帐.也就是入帐10W

可以增，也可以不增，增的话比较麻烦，需要验资和审计

不增的话，直接挂“其他应付款”，使用后冲回就可以了

感觉挂“其他应付款”肯定不对，应该是“资本公积--股本溢价”
借：资本帐户
贷：实收资本
资本公积----股本溢价
如果挂其他应付款，那公司的资产与权益状况就是不真实的，不能很好的反映真实发生的业务状况。
而且长期挂帐，税务查账不说，若你公司需要审计，那肯定是只能出具非标准审计报告了。到那时问题就是大大的了。
另注册资本只涉及印花税。