我们公司是公司的全资子公司，就一个会计一个出纳，我是会计。

财务基本的报销处理程序是：会计人员根据原始凭证填制报销单，出纳人员根据审核无误的单据办理支付业务。这是一条通用的报销程序，上级公司的财务经理一般不应干涉，但既然上级比较死板，提出这一要求，你可以婉转地把自己的理由向他说明，想他应该能够理解和支持你的工作，实在不行，和出纳人员商量好，可以先答应他，然后再按照自己的工作方法进行处理。

答应他,你自己怎么办的快怎么办.
他再来说的时候一样答应他,还是按照你的做`
就这样

这样确实是比较耽误时间。且凭证的份数也较多。每张原始凭证都要做凭证。可根据实际情况向总公司财务经理说明情况，只要是合情合理的，财务经理应该会考虑采纳的。
出纳审核好单据后，交会计复核签名，出纳根据会计签好名复核好的单据支付相应款项。然后会计再集中处理会计凭证。