连锁不平衡分析的参数标准有D'，r2，这两个值一般取多少是支持连锁不平衡啊？十分感谢

LD值 D' R2 计算
几个遗传学基本概念
1. 连锁不平衡
2. linkerd dimorphisms
3. 单倍型
4. 基因型的频率是如何计算的？（公式）
5. 等位基因的频率如何计算出来的？（公式）

连锁不平衡分析在连锁不平衡程度的评估，复杂疾病精细定位以及研究人类的历史和迁移中得到了越来越广泛的应用。连锁不平衡又称等位基因关联（allelic association），其原理其实很简单。假定两个紧密连锁的位点1，2，各有两个等位型（A，a；B，b），那么在同一条染色体上将有四种可能的组合方式：A—B，A—b，a—B，和a—b。假定等位型A的频率为Pa，B的频率为Pb，那么如果不存在连锁不平衡（如组成单倍型的等位型间相互独立，随机组合）单倍型A—B的频率就应为PaPb。而如果A与B是相关联的，单倍型A—B的频率则应为PaPb＋D，D是表示两位点间LD程度的值。如果位点2上的等位型B与疾病易患性有关，那么将会观察到等位型A的频率在病人群体中高于对照群体。换句话说，等位型A与该疾病性状相关。事实上，可以检测遍布基因组中的大量遗传标记位点，或者候选基因附近的遗传标记来寻找到因为与致病位点距离足够近而表现出与疾病相关的位点，这就是等位基因关联分析或连锁不平衡定位基因的基本思想。

等位基因(alleles)：同一位点上可能出现的基因，例如ABO血型基因

基因型(genotype)：同一位点上两个等位基因的组合。基因频率(allele frequency)：人群中一个等位基因占该位点全部基因的比例。

基因型频率(allele frequency)：人群中特定基因型占该位点全部基因型的比例。
如同一位点上两个等位基因分别为A和a,则A的频率（p）和a的频率(q)的之和为1。即p +q=1A基因的频率为p，a基因的频率为q。
该位点的基因型有三种，分别是AA，aa和A a。
基因型为AA的频率=p×p
基因型为aa的频率=q×q
基因型为Aa的频率=2×p×q

单倍型也叫单体型,单体型(haplotype)是指一条染色体上紧密相连的两个或两