琼脂糖胶回收大片段DNA的方法求助

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/05/31 08:19:30
请问哪位大侠知道回收大片段DNA的方法,我用天根的胶回收试剂盒,回收效果非常不理想,而且片段要比回收前小!
我从土壤里提取的DNA(23KB),所含杂质特别的多,所以最好只能用胶回收,求有经验的大侠指点!感激不尽!!!
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我没有用过国内的试剂盒,不过我非常肯定问题出在哪里。

首先,给你看一下Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System的回收效率与DNA大小的关系(下图)。这家公司的purification肯定比天根的好,但是在回收23000bp的DNA片段时,回收效率只剩下47%,这是因为回收DNA片段过大,即使在加水或者TE buffer溶解后,也无法滤过纯化柱,导致部分DNA遗失。而且,如果你是从琼脂糖胶上回收的DNA片段,回收率要再下降将近50%,这就是为何你的DNA回收效果不理想的原因。

我不是很明白什么叫做“片段要比回收前小”,难道你是直接将PCR产物进行纯化而没有做凝胶纯化吗?直接纯化对多个大片段DNA的纯化是没有意义的。所以,一定要先将你的全部PCR产物做凝胶电泳,再切出你的目标DNA片段,做凝胶纯化回收。

从你的实验结果看,估计你所用的试剂盒根本无法滤过23000bp的DNA分子,而只滤过了较小的杂质片段,这也是为什么纯化后目标基因变小的原因(实际上你回收的是杂质)。建议你联系天根公司,看他们是否有其他针对大片段DNA的试剂盒(我在国外,所以实在不知道国内的试剂品种,抱歉),然后,一定要做凝胶回收,而不是PCR产物直接纯化!

琼脂糖回收的DNA的问题 为什么融胶法回收DNA中,琼脂糖凝胶加入盐溶液,如NaI就能溶解? 请问从酶切后的溶液中如何回收DNA(不用切胶回收的方法)回收后的PCR产物是否适合于表达载体连接? 有谁知道"琼脂糖的提取方法" 垃圾回收的方法 dna的提取方法 DNA纯化的方法? DNA 提纯的方法 废电池的回收方法 易拉罐回收利用的方法