这两句话的意思矛盾吗？

^……完全不一样。
将在外军令有所不受，这个说的是将在外要根据实际情况，灵活应对，不能死板，不懂变通，关键时刻可以按照自己对战争的感觉采取与命令不同甚至完全相反的行为。
运筹帷幄决胜于千里之外，则说的是元帅或者军师，总之是这场战争的策划者，将军是执行者，和战略战术的策划者不一样，这个你要分清楚！
将军跟元帅、军师是两种完全不同的身份，一个是规划者，一个是执行者！这两句话很清楚了说明了这两个身份的主要职责，作为将军，你不要试图去做指挥者，你只要在目前所处的情况下灵活执行战术就可以了；而元帅、军师，则不要试图去冲在前线，不是能力范围之内的事情不要做！

不矛盾。
“将在外军令有所不受”是说指挥军队的将领，在前线作战的时候，可以不接受君主的不正确命令。
“运筹帷幄决胜于千里之外”是指善于谋划大局的人，可以在后方出谋划策，决定前线的战争胜败。一般指谋士。
两句话所指的对象是不同的。

完全两回事。

将在外军令有所不受。指外部形势突然变化，超出预期的计划，需要临机处置，作出超出计划的变动。

运筹帷幄决胜于千里之外。指谋划能力强 ，虽然不在现场，但是制定的战略性计划，非常符合实际情况，依照执行，就能够取得胜利。

不矛盾，用在不同地方，指不同人物的。

两种话的前提不同！前者指挥者与后者指挥者有着明显智商上的差距！

这两句是不矛盾的。第一句里的将，是针对远在千里之外不直接参与现实战争的人而言的。而运筹帷幄的人，通常是指在实地作战中的主心骨。因此，不矛盾的。