公司开了基本户和一般户，但是之前的会计只把基本户入账，一般户不入账，请问下这样做会有什么问题和后果

一般户不入账是税法不允许的，可以认定你是帐外资金，收入不入账，偷税漏税，这是很明显的。风险太大。
需要查出一般户资金的来历原因，如果不是收入的可以挂往来。

应该入账，即便不入账只要有款项进企业银行账户，那也是隐瞒不了的。财税实践的经验教训告诉我们：只要走企业银行账户的款项，千万别有偷税漏税的念头。

你要调整他留下来的烂摊子了。调错帐，把一般户跟基本户的业务理清，一条条列出来。 直到跟对帐单对得上号为止。

同意二楼的说法，必须要对起来。银行存款账户是一清二白的，每一笔业务都要在来笼去脉。