商品外包装上的条形码（比如盒子）和内部的单个物品条码不一样是怎么回事啊？是被骗了吗？

一般来说商品外包装上的盒子是国际商品码，主要用于商品流通的；
内部的单个物品有可能是企业内部码，主要是便于企业内部管理，以及对产品质量追踪所用的；
两者的码制是不一样的，前者通常是EAN13码，后者多用的是128码，39码等。