请问：做微生物质粒转化耐药实验是否不限菌种？

不是不限，而是没法说。
问题就在于带有抗性基因的质粒能否在宿主中稳定存在以及有效表达和遗传。
这就关系到质粒本身的性质和宿主菌的情况。
质粒种类很多，宿主菌的类别更多了，不仅仅和菌的种类有关，同一种菌的不同菌株效果都会有差异。
某种新获得的质粒能否成功转入到某个受体菌株中还是要通过实验来确定，目前的理论上无法做出判断，同种异种都可以做，但未必都能成功。
学生实验做的一般是用人工质粒和大肠杆菌某些菌株。