我今年6月份拿到报关资格证，现在在一工厂做关务，考虑是否要拿资格证去注册？

首先纠正一点，资格证不去注册是不会作废的，终身有效，再者都还没有去注册过何来年审？不是在扯淡么？所以去不去注册那看你自己咯，没有什么所以必须不必须。
当然考虑到你的证是新证，如果以后要去注册要先实习备案三个月后才能用，所以不妨去备案三个月注册了先。省得以后如果需要证时还得去备案三个月才能注册成为报关员。

需要注册，到直属海关的企业管理处办理，现在企业和报关员年审权限已经下放了，应该隶属海关也可以年审，但注册应该在直属海关，具体建议事先问一下海关的业务咨询部门。
另外报关员注册应该有一个确定的公司，也就是你是哪家公司的报关员，所以你可能需要先在海关给自己的单位做好注册和年审，然后注册自己的报关员证，强烈建议你要先向企业管理处企业备案管理科咨询清楚，但一定不要拖，过了时间期限会很麻烦。
当然挂靠一家外贸公司或报关行的也有。看你怎么操作。

好厉害，你是我的偶像了，我还在考，好难

最好是注册一下，否则报关证书要失效的。

非注册不可，要是没有注册就没办法年审，没办法年审就作废了