细胞如何怎么确定转录哪一条染色体的单链?

一个染色体在同一时间不是只有一段（基因）被转录的，而是很多地方同时进行，取决于promoter的信号。
不过我觉得你问的问题是不是等位基因的问题啊？。。。allele..
转录成mRNA的时候两条链都转录的，一个例子就是人的ABO BLOOD TYPE.

这就取决于mRNA的种类了
不同的mRNA上的碱基是不同的。就使得不同的mRNA可以与DNA的不同部位结合，进行转录。根据碱基互不配对原则（A对应mRNA的U,T对应mRNA的A，C对应mRNA的G，G对应mRNA的C）可以由mRNA上的碱基排列顺序得出它所转录的DNA的碱基顺序。
从而得出是转录哪条单链。

you'll need to know promoter first

赞同，qas168888