外商投资企业批准证书哪里去办理变更？

不会吧，你没先变更批准证书就变更了营业执照？
批准证书变更具体要什么材料上当地外经贸局或商务局网站的办事指南查询，大概是章程修正案、董事会决议、投资方决议、新租赁合同和产权证复印件之类，外汇登记变更的上外管网站。