柯南（工藤新一）会与基德对抗黑衣组织吗

答案是肯定的，
你看看《魔术快斗》就知道了，基德也在找组织报杀父之仇呢
（《魔术快斗》也是青山刚昌创作的另外一部以“怪盗基德”为主角的漫画，是《柯南》姊妹篇，工藤新一也在里面出场，网上可以找到漫画版的【有几集和《柯南》里面是一模一样的】）

而且，身为怪盗基德的黑羽快斗，以前是一向不会主动去接近侦探的，即便是同班同学的白马探，他也主要是以“避免接触”的战略为主，很少主动往枪口上撞的。而对于柯南，他却是一次又一次的主动接近——很可能是快斗知道柯南和自己有共同目标了

这要问“青山刚昌”

相信会的!因为基德也想对付黑衣组织，相信他们会联手的!！

基德不是坏人，我想他会的。

一定会的。