哪个出版社出版的四库全书比较好？

商务印书馆出版的是文津阁本《四库全书》，上海古籍出版社出版的是文渊阁本。
论编校质量大概文津阁本好些。
文津阁本是北方四阁本最后一部抄成的，且距第一部文渊阁本成书有三年之久，对前三阁抄本存在的一些讹误作了修正，《四库全书》在成书后，曾作过两次全面复查，而这两次复查，文津阁本都是由总纂官纪晓岚(昀)亲自带领有关人员进行的。其中集部差异达百分之六十二，史部差异则达百分之五十一。这些差异不仅存在于文字、提要和序、跋、附录，甚至在篇、卷上也存在重大差异，仅以宋人别集而言文津阁本多于文渊阁本即有一百二十八种书一千多篇文。