J2EE方向要不要深入学网页设计和javascript?

前端的确由前端工程师负责，但是也要看你的公司有没有人担任这个职位。一般大公司才会有专职的前端工程师。要不就像kanful所说的，一般公司就只懂得美工和程序员2种职位。
javascript的水很深，可以说不比java浅，学习起来甚至比java还要痛苦……（因为太灵活了，很容易出错）。好的前端工程师都会至少一门后台编程，因为涉及到数据传输，懂得后台能够更好的服务前台。
除非你确定你将来要进的公司一定会有前端工程师，否则还是要学一下比较好。

你说的网页设计，有两种意思。一种是，美工。一种是开发人员。
我觉得现在j2ee的开发人员。不需要精通美工和样式。但下面一面网页相关的还是需要了解的。html,css,javascript.
特别是做ajax的话。会这些的话，可以提高竞争力。你去看一下人才网的招聘。java开发的，几乎都要会 html ,javascript， css 不用精通。但要熟悉。

不管你以后主要做后台，也需要了解。不然，就算你职位上去了。这些东西你都不懂。怎么管好下面的工作。

其他人说的对， 你是J2EE方向 就是主要负责写后台程序的，前端显示是有前端工程师+美工负责的， 建议你继续钻研后台，别去理会前端，做网站是一个团队的事情，自然有人去操心前端表现。

公司不会指望你们理科生来设计出好看的网页，你的长处就是后台具体功能的实现，也就是应用的核心，而不是花里胡哨的外表。J2EE很复杂，深入钻研一个点都力有未逮，何况其他。