06年吉林大学大专毕业,毕业时户口打回原籍,原籍是山西省运城市,可迁移证写的是太原市,现在都过期3年了,

那要看户口在哪，身份证只能在户口所在地办理!
至于你的迁移证为什么写太原？一般情况都会写上一级城市，因为这样你可以随意迁到下一级的城市，比较方便。如果你定死在运城市，要想往太原市迁就很麻烦，这是学校为了大家方便才会这样派的！

完全可以就在太原办个身份证，我们当初上学都是办的太原的身份证，先去派出所办了手续，把时间补上。再办身份证，不难。就是麻烦。

主要是你户口现在在哪里？在哪里就到哪里办

直接回运城去问。网上问你觉得有用吗？