从土豆网下载视频在手机上只有一个耳麦有声音……

首先，在电脑上看下源文件（FLV格式）是两个耳机响，还是一个耳机响，或是一边是音乐一边是人声，如果是这种情况，转换时选择声道为单声道（即1个声道）；
如果电脑上的源文件正常，转换时随便选什么都行了。（3GP一般只支持单声道）。

你看看设置了立体声的没有……
要么是文件本身有问题，要么你转换时设置不当。
话说回来，手机看的话转成单声道就足够了嘛。

还有，也可能是你的耳麦问题，换个正常的视频文件播放试试看。

转成单声道