拿到对方转账支票进账，一定要去本公司的开户行进账吗？

可以在你公司的开户行和对方单位的开户行去办理,但背书有所不同.在你公司开户行进帐时背书要盖预留的银行印鉴,填写开户行名称,时间,委托收款;在对方开户行办理时背书只填写你公司的名称,开户行,账号,时间.均填写进账单.
同一个银行的其他支行不能办理,只能到你或对方开户行办理.