出口的进料加工贸易手册核销，有部分是内销的请问具体操作应该怎么做？

一般来说，是要按照全部产生的量补税内销；
具体尺度，还是跟当地海关咨询，请他们判断为准。

进料加工项下进口的料、件和加工成品，均不得在境内销售。如因故必须转为内销的，应经经贸部主管部门批准，并经海关许可。上述转内销货物，无论以人民币或外汇结算，经营单位和加工生产企业应及时想海关缴纳原进口料、件的关税、产品税（或增值税）。属于国家限制进口的或属于实行进口许可证管理的商品，应按国家有关规定向海关交验进口审批件或进口许可证后方可准内销。