我居住我叔父的房屋已经四十多年了

未听说过房屋被侵占超过二十年不闻不问就等于自动放弃的说法。对于你将的情况，产权清晰，所有权人明确，不能说超过二十年就自然改变产权权属。从法律角度分析，该房屋权属仍为你叔父所有，但如果他想要回的话，你可以要求他给你一定的补偿。