“是药三分毒有”什么科学依据吗？

有一定道理

不过yangfang1983 说得完全不对。抗菌药物及抗病毒药物只是所有药物的一小部分，杀死病菌不会在身体里残留什么，而且不会损害抵抗力。

药都是有毒性的，它能帮助你把那种病菌杀死就会留下一些残留在身体的物质，长期大量使用会导致人的免疫系统降低天然的抗病毒能力