柯南第10剧场版中为什么开始把柯南留下？难道他们知道柯南身份？

实际上他是不知道柯南的身份的

因为椅子扶手上有指纹识别系统，所以伊东知道和毛利一起来的是“新一”。但是他眼睛看不见，并不知道“新一”变成了“柯南”。他一直以为和毛利在一起的、后来开始调查的、到最后到他面前的都是“新一”。他根本不知道有“柯南”这个小孩参与其中。
所以柯南知道这点后一直用新一的声音和他讲话，在最后情急之下他没用变声器说话时，伊东还说：你的声音听起来如此年轻。。。汗

他一直以为他留下的是“新一”，因为椅子扶手上的指纹识别系统告诉他那人是新一，他眼睛看不见，只有用这种方法来识别来访的人。
至于“柯南”我想他根本没有在意这个小孩，或者他根本不知道这小孩的存在。

伊东通过椅子上的指纹识别系统以为新一也来了，就将柯南一起留了下来
不过觉得奇怪的是，那位助手先生难道一点也不怀疑吗？堂堂高中生侦探，怎么会是小孩呢？

那个大厅的椅子有指纹识别系统，柯南的指纹和新一的指纹一样啊，委托人又看不见，所以只能靠系统来确认来的人是谁了。

剧场版最后都说了嘛，这是因为那房间里的椅子上有指纹识别器，而那个主人又是个盲人，电脑告诉他，这是工藤新一的指纹。他是想留下工藤新一阿……