医给小孩开的出生证明上的日期是阳历，那给小孩上户时可以用农历吗？

有关系可以的，不差那几天！
但是要是负责任的户籍警察估计不会同意的！
法律规定所有公文函件都要使用公历，也就是阳历！

不可以。
农历不是法定登记管理使用的日期，违背户籍管理制度，派出所不会给你办的。

户籍登记以出生证明上的日期为准,派出所是不会同意你的要求的。