怎样查询来证明网上的一家公司是否是真的、正式的公司？

没听过。
不过通常证明网上的公司是否正是的公司有两个方法：
一，通常比较正规的网店都会备案，你可以在网站找找有没有关于备案的标志，通常在网站的最下边。想看看是什么样子的看看国内几个大型购物网站的最下面就知道了，有备案号的。
二，查阅公司相关资料后直接在公司所在地工商行政部门可以查到是否有那个公司登记资料。要收费的，不过不会很高。注意要分清是该公司应该规那个工商部门登记，省的市的还是地区的。

本人暂时只想到这两个，希望有帮助。