06年毕业的硕士研究生，档案和户口都放在人才中心，有工作单位（私企），这样还具备国家干部身份吗？

这个干部身份会因地区而差异吗？比如河北省承认而北京不承认，会和工作单位的性质有直接关系吗？

没差异!
没直接关系!

硕士毕业后怎么办转正定级手续？听说直接是初级，那这个初级需要什么文字性的东西吗？
这个要问你们单位了!单位和单位是不同的,一般私企没这一说!就是签订劳动合同就干罢了~