为什么等位基因不能是AA这样的呢？

等位基因是指位于一对同源染色体相同基因座位上的、决定一对相对性状的基因。
也就是说，1对等位基因是决定某种性状的不同方面，当然这一对等位基因之间是彼此不同的，
纯合子AA中两个A基因是相同的，所以不属于等位基因。

如楼上：兔的毛色 就是某种性状，而白色和黑色就是一对相对性状，决定二者的基因应该就是1对等位基因，黑色基因和白色基因就是不同的。

（不过，楼上所举之例中，毛色有多种，决定的基因也有多种，如果他们都是位于1对同源染色体上的相同位置上的话， 应该属于1组“复等位基因”，而不是简单的等位基因。）

国内个别教材上D和D，d和d不是等位基因的说法是错误的。错误在于，没有理解所谓等位基因是多个基因中的一个，而是从中文字面上望文生义，想当然的认为只有两个基因，才能相互之间叫做等位基因，所以才会有D和D是不是等位基因的问题。而且更进一步认为，只有D和d才能相互之间叫做等位基因，这就更不对了。（注：国内高中课本必修二课本将等位基因定义为：控制一对相对性状的基因。而由于D与D不是控制相对性状的基因所以不能称作等位基因.

等位基因是指在一对染色体上位置相同的基因。在一个位置上的基因往往有多种可能的形式，由突变产生，实际存在于一个个体的基因是一组突变基因中的两个。
例：兔的毛色基因，B使兔毛呈灰色，b1呈黄色，b2呈青色，b3呈棕色，b4呈黑色。B、b1、b2、b3、b4叫做“一组”等位基因，兔的基因型可能是BB、b1b2、Bb4等，都叫“一对”等位基因

等位基因是杂合子